Οι Μύλοι είναι μέρος της τοπικής κοινότητας Χρωμοναστηρίου του Δήμου Ρεθύμνης στην περιφερειακή ενότητα Ρεθύμνου της περιφέρειας Κρήτης που ιδρύθηκε με τη μεταρρύθμιση του Καλλικράτη. Η πρωτεύουσα του νέου δήμου είναι το Ρέθυμνο.

Όταν μιλάμε για τους Μύλους αναφερόμαστε τόσο σε ένα χωριό που χτίστηκε στις αρχές της δεκαετίας του 1970 («νέοι Μύλοι») όσο και σε δύο εγκαταλελειμμένα μικρά χωριά με το ίδιο όνομα (ή αναφέρονται ως «άνω Μύλοι» και «Κάτω Μύλοι»), ερείπια των οποίων συναντάμε μέσα στο φαράγγι των μύλων.

Το φαράγγι των Μυλών είναι ιδανικό για περιήγηση από όλη την οικογένεια καθώς χρειάζεται μόλις μία ώρα για να διασχίσετε το καταπράσινο τοπίο. Το φαράγγι ξεκινά από το Χρωμοναστήρι και καταλήγει στο Ξηρό Χωριό.

Υπάρχει ένα μικρό ποτάμι μέσα στο φαράγγι και το έρημο παλιό χωριό Μύλοι, όπου μπορεί κανείς να δει δείγματα παραδοσιακής αρχιτεκτονικής, παλιές εκκλησίες και σπηλιές.